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孙成

作者: | 来源: | 发布日期:2022-11-18 | 阅读次数:

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孙成,博士、研究员

首都师范大学det365娱乐官网登录

地址:北京市海淀区西三环北路105

Emailcheng.sun@cnu.edu.cn

transposable.element@gmail.com

ORCID: https://orcid.org/0000-0001-7476-9224

ResearchGate: https://www.researchgate.net/profile/Cheng-Sun-15

主要研究方向

在自然界中,78%的开花植物和75%的粮食作物需要通过动物(尤其是蜜蜂科昆虫)进行传粉才能繁衍后代蜜蜂科昆虫不仅维护着自然生态系统的稳定、促进农业生产,而且也逐渐成为研究动物行为演化、环境适应性的理想材料。本实验室主要以蜜蜂科熊蜂属的昆虫为研究对象,采用基因组学、生物信息学、以及分子生物学方法

1、研究熊蜂基因组演化、表型多样化以及物种分化的分子机制,尤其是转座子等重复序列在这些过程中的作用。

2、探究熊蜂社会分工行为的演化,尤其是社会性寄生行为产生的遗传基础。

3、挖掘熊蜂中与环境适应性相关的基因采用保护基因组学方法监测熊蜂的种群动态鉴定出威胁熊蜂种群的环境因子,进而制定相应的保护措施。

4、挖掘与熊蜂繁育、耐逆、授粉性能相关的基因,并利用这些基因培育具有优良品质的国产蜂种,促进农业生产。

5、完成上述研究内容所需的生物信息学工具开发与流程搭建。

研究生招生专业(硕士、博士)

生物信息学、生态学

工作、学习经历

2022.9至今 首都师范大学 研究员

2015.102022.8 中国农业科学院蜜蜂研究所 研究员

2011.32015.8 美国Colorado State University 博士后

2009.22010.12 美国University of Texas at Arlington 博士后

2004.92009.1 中国科学院遗传与发育生物学研究所 博士研究生

2001.92004.7 哈尔滨师范大学 硕士研究生

1997.92001.7 吉林师范大学 本科生

主持的课题

国家自然科学基金面上项目, 熊蜂社会性寄生行为产生的分子机制, 2023.1-2026.12

国家自然科学基金面上项目, 基于群体基因组与转录组数据研究串联重复序列对熊蜂环境适应性的影响, 2020.1-2023.12

代表性论文(*通讯作者)

1. Sang H, Li Y, Sun C*. 2022. Conservation genomic analysis of the Asian honeybee in China reveals climate factors underlying its population decline. Insects. 13(10):953.

2. Cao L, Zhao X, Chen Y, Sun C*. 2021. Chromosome-scale genome assembly of the high royal jelly-producing honeybees. Scientific Data. 8: 302.

该研究成果被评为“2021浙江科技大事件TOP10”

3. Ding L, Sang H, Sun C*. 2021. Genus-wide characterization of nuclear mitochondrial DNAs in bumblebee (Hymenoptera: Apidae) genomes. Insects. 12(11):963.

4. Sun C*, Huang J, Wang Y, Zhao X, Su L, Thomas GWC, Zhao M et al. 2021. Genus-wide characterization of bumblebee genomes provides insights into their evolution and variation in ecological and behavioral traits. Molecular Biology and Evolution. 38(2):486-501.

Nature Reviews Genetics评为研究亮点 (doi:10.1038/s41576-020-00294-9)

5. Tan H, Naeem M, Ali H, Shakeel M, Kuang H, Zhang Z, Sun C*. 2021. Genome sequence of the Asian honeybee in Pakistan sheds light on its phylogenetic relationship with other honeybees. Insects. 12(7):652.

6. Zhao X, Su L, Xu W, Schaack S, Sun C*. 2020. Genome-wide identification of accessible chromatin regions in bumblebee by ATAC-seq. Scientific Data. 7: 367.

7. Zhao X, Su L, Schaack S, Sadd BM, Sun C*. 2018. Tandem repeats contribute to coding sequence variation in bumblebees (Hymenoptera: Apidae). Genome Biology and Evolution. 10(12):3176–3187.

8. Sun C, Feschotte C, Wu Z, Mueller RL. 2015. DNA transposons have colonized the genome of the giant virus Pandoravirus salinus. BMC Biology. 13(1): 38.

9. Sun C, Mueller RL. 2014. Hellbender genome sequences shed light on genomic expansion at the base of crown salamanders. Genome Biology and Evolution. 6(7): 1818-1829.

10. Sun C, Wyngaard G, Walton DB, Wichman HA, Mueller RL. 2014. Billions of basepairs of recently expanded, repetitive sequences are eliminated from the somatic genome during copepod development. BMC Genomics. 15(1): 186.

11. Sun C, López Arriaza JR, Mueller RL. 2012. Slow DNA loss in the gigantic genomes of salamanders. Genome Biology and Evolution. 4(12): 1340-1348.

F1000推荐阅读(http://f1000.com/prime/718020336)

12. Sun C, Shepard DB, Chong RA, López Arriaza J, Hall K, Castoe TA, Feschotte C, Pollock DD, Mueller RL. 2012. LTR retrotransposons contribute to genomic gigantism in plethodontid salamanders. Genome Biology and Evolution. 4(2): 168–183.

13. Arensburger Peter and many authors. 2010. Sequencing of Culex quinquefasciatus establishes a platform for mosquito comparative genomics. Science. 330:86-88.

14.The International Brachypodium Initiative. 2010. Genome sequencing and analysis of the model grass Brachypodium distachyon. Nature. 463:763-768.

发明专利

1、商业地熊蜂与野生地熊蜂的差异INDEL及其分子标记与应用

2、一个商业地熊蜂与野生地熊蜂的差异基因及其分子标记与应用

社会兼职

Frontiers in Genetics编委

Molecular Ecology, Agriculture, Ecosystems and Environment, Genome Biology and Evolution等杂志审稿人

第三次全国畜禽遗传资源普查技术专家组成员